Член Союза архитекторов России, член архитектурной комиссии Градостроительного Совета Московской области, профессор Международной академии архитектуры в Москве (IAAM).

Более 17 лет руководит архитектурным бюро «Крупный план». KPLN - одно из ведущих архитектурных бюро полного цикла (ТОП-30 Forbes), в тройке лидеров ТОП-50 архбюро (рейтинг Urban 2025), лучшие проектировщики жилья в России (ТОП-20 Движение.ру 2025).

Автор архитектурного облика МКЦ возле станции метро «Теплый стан», отмеченного престижной премией мира World Architecture Festival (WAF), и аэропорта Архыза - первой воздушной гавани в Карачаево‑Черкесской республике.

Проекты Сергея Никешкина награждены крупными российскими и международными премиями, такими как World Architecture Festival, Urban Design & Architecture Design Awards (UDAD Awards), «Зодчество», «Золотое сечение», «Проект Россия», премия Архсовета Москвы, CRE, АрхиWOOD.

Член жюри премии Urban, Real Estate Property Awards, 100+ Awards, член экзаменационной комиссии на защите дипломных проектов в Институте бизнеса и дизайна. Эксперт-спикер ведущих вузов и бизнес-форумов России.